АО "Научный центр акушерства, гинекологии и перинатологии" организован в 1975 году и является ведущим и наиболее крупным научным учреждением в Казахстане по реализации политики государства в области охраны репродуктивного здоровья населения, определению и координации перспективных научных исследований, интегрированию в мировое научное сообщество.
В поликлинике НЦАГиП оказывается консультативный специализированный прием по 14 специальностям более 30000 женщинам в год из различных регионов Казахстана. В центре внедрен «Генетический паспорт человека», который осуществляет доклиническую диагностику и лечение тяжелых заболеваний с учетом генотипа каждого пациента. А также с 2007 года ведется генетический скрининг беременных и Неонатальный скрининг. Генетический скрининг прошли 805 тысяч беременных, проведено 19 тысяч инвазивных пренатальных процедур, диагностировано внутриутробно и предупреждено рождение 893 детей с синдромом Дауна, 5600 детей с летальными ВПР. Международное признание получили исследования центра в области медико-генетических последствий многолетних ядерных испытаний на Семипалатинской полигоне, результаты которых вошли в итоговый национальный доклад генеральной Сессии ООН. Дальнейшее изучение медико-генетических аспектов перинатальной патологии, изучение генотоксического влияния окружающей среды на мать – плод – новорожденного, пропаганда гигиены зачатия, поиск и развитие новых методов пренатальной и постнатальной диагностики муковисцидоза и ФКУ в РК, проведение трехуровневой профилактики генетических нарушений – таков прогрессивный подход к формированию здоровой конкурентоспособной нации. Ежегодно НЦАГиП проводятся международные и республиканские конференции, съезды и симпозиумы, научно-практические семинары. Научные разработки и практические рекомендации сотрудников центра включены в директивные документы Министерства здравоохранения и национальные программы. Признанием безупречной репутации в деловой практике учреждения является присвоение Общественным фондом «Национальная лига потребителей Казахстана» народного знака качества «Безупречно», награждение Золотой медалью Международным фондом «За высокое качество в деловой практике», укреплением имиджа и конкурентоспособности учреждения стало получение награды «Лидер отрасли» Международной программы «Эстмейкер». В 1998 году впервые в Казахстане НЦАГиП присвоено звание Больницы Дружелюбного Отношения к ребенку. В 2012 году получен Сертификат соответствия №KZ7500207.07.03.00158 оказания лечебной и консультативно-диагностической помощи и проведению научных исследований, подготовке медицинских кадров в акушерстве, гинекологии и перинатологии – соответствует требованиям СТ РК ИСО 9001-2009 «Система менеджмента качества» и Внедрение Европейского фонда менеджмента качества (EFQM) для уровня «Стремление к совершенству»(CjmmittedtoExcellence) от 26.12.2012 года. Выпущен Международный ролик для «ЭКСПО 2017» (Париж, 2012 год). НЦАГиП стал победителем Конкурса «Компания года 2013» в номинации «Здравоохранение» Межрегионального финансово-экономического союза России и включен в «Реестр бизнес-партнеров МФЭС».